Bakteri Rhodopsin, membran proteini Bacteriorhodopsin bacteriopsin, HsBR sağlıyoruz.

Hücresiz proteinimizİşlev doğrulandı.

Giriş

Bacteriorhodopsin (BR), arkeobakterilerde ışıkla çalışan bir proton pompası görevi gören 7 transmembranlı bir proteindir.Kovalent olarak bağlı renkli ligandı nedeniyle BR, örneğin kristalizasyon deneyleri ve biyokimyasal / biyofiziksel deneyler için bir kontrol membran proteini olarak yaygın olarak kullanılmaktadır.

yapı

Bacteriorhodopsin, genellikle "mor membran" olarak bilinen ve arkeal hücrenin yüzey alanının yaklaşık% 50'sini kaplayabilen iki boyutlu kristal yamalar içinde bulunan ayrılmaz bir membran proteinidir.Altıgen kafesin tekrarlayan elemanı, her biri diğerlerine göre 120 derece döndürülmüş üç özdeş protein zincirinden oluşur.Her zincir yedi zar ötesi alfa helisine sahiptir ve retiniliden proteinleri için tipik yapı olan bir derin retina gömülü molekülü içerir.

fonksiyon

Bakteritodopsin mikrobiyal rhodopsinlere aittir.Retinada ışığı algılayan pigmentler olan omurgalı rhodopsinlerle benzerlikleri vardır.Rodopinler ayrıca retinal içerir;ancak, rodopsin ve bacteriorhodopsin fonksiyonları farklıdır ve amino asit sekanslarında sınırlı benzerlik vardır.Hem rhodopsin hem de bakteriorhodopsin, 7TM reseptör protein ailesine aittir, ancak rhodopsin G proteini ile birleştirilmiş reseptördür ve bacteriorhodopsin değildir.

Bakteriorhodopsin molekülü mor renktedir ve yeşil ışığı emmede en etkilidir (dalga boyu 500-650 nm, absorpsiyon maksimum 568 nm'de).Bacteriorhodopsin geniş bir uyarım spektrumuna sahiptir.700 ve 800 nm arasındaki bir tespit dalga boyu için, 470 nm ila 650 nm arasındaki uyarım dalga boyları için (570 nm'de bir tepe noktası ile) kayda değer bir saptanmış emisyona sahiptir.633 nm'de pompalandığında, emisyon spektrumu 650 nm ile 850 nm arasında kayda değer bir yoğunluğa sahiptir.

Bakteriorhodopsin fotosiklinde ana proton transferleri.Taşıma aktivitesi için önemli olan protonlanabilir gruplar ve bağlı su molekülleri, sırasıyla çubuk temsili ve mavi küreler olarak gösterilmiştir (PDB ID: 1C3W).Oklu sayılar proton transfer reaksiyonlarının sırasını temsil eder, foto ara maddeler arasındaki karşılık gelen geçişler ekte gösterilir.TM sarmalları aşağıdaki renklerde gösterilmiştir: A, mavi;B, deniz mavisi;C, yeşil;D, limon yeşili;E, sarı;F, turuncu;G, kırmızı;ve kromofor siyah çubuklar olarak tasvir edilmiştir.BH RSBH'den proton transferi⁺birincil proton alıcısı Asp85'e;The proton salım kompleksinden hücre dışı ortama proton salımı;B RSB'nin primer proton vericisi Asp96'dan yeniden protonlanması;96 Asp96'nın sitoplazmik ortamdan yeniden protonlanması;Asp Asp85'ten proton salma kompleksine proton transferi.

Yukarıdaki bilgiler Chem Rev. 2014 Ocak 8;114 (1): 126-163.Çevrimiçi yayın tarihi 2013 23 Aralık. Doi: 10.1021 / cr4003769

Şartname