20 ng / μl MRPP 20 μl Metajenom Sekanslama Moleküler Genetik Analiz

Giriş

Doğal mikroorganizmaların% 99'dan fazlası klonik olarak izole edilemez ve kültürlenemez.Geleneksel izolasyon ve kültüre bağımlı yöntemler doğal ortamlarındaki mikroorganizmaların çalışmasını sınırlandırmıştır.Çevresel numunelerden doğrudan geri kazanılan genetik materyalin metagenomik çalışmaları, mikrobiyal biyoçeşitliliğin araştırılması için bir yöntem olarak ileri NGS teknolojisinden büyük ölçüde faydalanmıştır.

CELLFREE'nin metagenomik araştırma hizmeti, çevresel numunelerden izole edilen DNA'nın tüm genom tüfeği dizisini uygular, yüksek verim ve yüksek kapsama avantajları ile.Sadece tür bileşimi ve bolluğu hakkında değil, aynı zamanda fonksiyonel genler, numuneler arasındaki gen farklılıkları, metabolik yollar ve biyoaktif ürünler için gen kaynağı madenciliği hakkında da bilgi sağlayabilir.

avantaj

• Son derece deneyimli: Müşterilerimiz için 400'den fazla metagenomik sıralama projesini tamamladık ve çoklu metagenomik çalışmalar yayınladık.
• Üstün hizmet: Yüksek kaliteli sekanslama, verimli bir standart iş akışı ve biyoinformatik analizleri maliyet etkin bir fiyata sunuyoruz.
• Etkili metodoloji: Tekniklerimiz, az miktarda bulunan türlerden veri üretimini arttırır.
• Kapsamlı analiz: Üç veritabanıyla (KEGG, eggNOG, CAZy) uzman biyoinformatik analizi, açıklamalı genler ve metabolik yollar hakkında kapsamlı veriler sağlar.

Veri Kalitesi Garantisi

• Her numune için Q30 ≥% 80 ile 6Gb ve 12Gb paketleri sunulmaktadır.

Analiz Listesi

• Standart analiz paketimiz gen tahmini, fonksiyon açıklaması ve taksonomik açıklama, mPATH, ısı haritaları, PCA, Krona, küme analizi, MetaStats ve OG-Taxa'yı içerir.
• Gelişmiş analiz paketimiz MRPP, ANOSIM, NMDS (metrik olmayan Çok Boyutlu Ölçekleme), CCA / RAD ve LEfSe'yi (LDA Efekt Boyutu) içerir.

Örnek Gereksinimleri

• DNA miktarı: ≥ 1 μg
• DNA konsantrasyonu: ≥ 20 ng / μl
• DNA hacmi: ≥ 20 μl
• Saflık: Parçalanma yok, RNA kontaminasyonu yok

Geri Dönüş Süresi

• Numune kalitesinin doğrulanmasından itibaren 25 iş günü içinde (veri analizi olmadan)
• Veri analizi için ek 10 iş günü

Tavsiye Edilen Sekans Derinliği

• İki strateji: 6 Gb ham veri veya 12 Gb ham veri